明朝的衰亡始于万历时代。明神宗在位四十八年，是明代在位时间最长的皇帝。神宗28岁就为自己修建陵墓，可见神宗身体状况不佳，且神宗疏于朝政。而在宫廷之内，宦官专权也深刻影响了医药制度。明代的御药房是为皇帝健康服务的一个最直接部门。明初叫尚药局，后改为御药局，嘉靖十五年（公元1536年），在紫禁城的文华殿后面又建了圣济殿，作为御药房办公所在。圣济殿在李自成攻入紫禁城后被烧毁。万历三年(1575)又规定：